RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.24■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa16.23■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 COX7A2LO14548 114 aa16.23■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.23■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 NPSP0C0P6 89 aa16.22■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.22■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 LINC01546A6NGU7 62 aa16.21■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 MT-ND6P03923 174 aa16.21■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.21■□□□□ 0.19
RP9-201ENST00000297157 IGIPA6NJ69 53 aa16.2■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 SPACA4Q8TDM5 124 aa16.2■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 TMEM141Q96I45 108 aa16.19■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 IFITM10A6NMD0 228 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 APOC3P02656 99 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 SVBPQ8N300 66 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 LINC00526Q96FQ7 95 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 AMELXQ99217 191 aa16.18■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 COX6A2Q02221 97 aa16.17■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 C5orf38Q86SI9 138 aa16.17■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.17■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 SNAPINO95295 136 aa16.16■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 CHTF8P0CG12 524 aa16.16■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.16■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.15■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 MT1HL1P0DM35 61 aa16.15■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 MALP21145 153 aa16.15■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 C2orf48Q96LS8 159 aa16.15■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RP9-201ENST00000297157 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 UBE2D1P51668 147 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 SYCNQ0VAF6 134 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 TOMM6Q96B49 74 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 CARD19Q96LW7 228 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 YPEL4Q96NS1 127 aa16.14■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 APOMO95445 188 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 G0S2P27469 103 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 NDUFA5Q16718 116 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 TIMM17AQ99595 171 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 PLAC8Q9NZF1 115 aa16.13■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 A0A087WYN8 130 aa16.12■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.12■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 A0A087WZ39 114 aa16.11■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.1■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 Q6ZRU5 148 aa16.1■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 A0A096LNI7 61 aa16.09■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa16.09■□□□□ 0.17
RP9-201ENST00000297157 F8WDY8 70 aa16.08■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 Q6ZN92 141 aa16.08■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 LINC01561Q8N1V8 128 aa16.08■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 VCX2Q9H322 139 aa16.08■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.08■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 SPAG11BQ08648 103 aa16.07■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 RNF151Q2KHN1 245 aa16.07■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 ERASQ7Z444 233 aa16.07■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 TNXBP22105 4242 aa16.07■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 LINC01549A6NIU2 74 aa16.06■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 KIAA0087Q14695 138 aa16.06■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 C2orf88Q9BSF0 95 aa16.06■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.05■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.05■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.05■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 LINC00474Q9P2X8 69 aa16.05■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa16.05■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa16.04■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.03■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa16.02■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 MAJINQ3KP22 176 aa16.02■□□□□ 0.16
RP9-201ENST00000297157 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa16.01■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 PTTG1IPP53801 180 aa16.01■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 SCGB3A1Q96QR1 104 aa16.01■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 A0A096LNJ9 63 aa16■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 FA2HQ7L5A8 372 aa16■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 STPG4Q8N801 248 aa15.99■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 DPH3Q96FX2 82 aa15.99■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 LRP2P98164 4655 aa15.98■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 SEC11AP67812 179 aa15.98■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 C10orf25Q5T742 122 aa15.98■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 NDUFA1O15239 70 aa15.97■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 HERVK_113P63121 156 aa15.97■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 TLX1NBP0CAT3 122 aa15.96■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.96■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.96■□□□□ 0.15
RP9-201ENST00000297157 LINC00614P0C842 121 aa15.95■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.95■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.95■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.94■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 CST9LQ9H4G1 147 aa15.94■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.94■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 A0A0J9YXV3 536 aa15.93■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.92■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 CBLN2Q8IUK8 224 aa15.92■□□□□ 0.14
RP9-201ENST00000297157 GAGE2BQ13066 116 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms