RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNRNP25-201ENST00000293861 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.84□□□□□ -0.03
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SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0B4J2C4 111 aa14.83□□□□□ -0.04
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SNRNP25-201ENST00000293861 HERV-K104P63124 156 aa14.82□□□□□ -0.04
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SNRNP25-201ENST00000293861 PRO1854Q9UHT4 67 aa14.82□□□□□ -0.04
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPAN13O95857 204 aa14.82□□□□□ -0.04
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SNRNP25-201ENST00000293861 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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SNRNP25-201ENST00000293861 IGHV3-33P01772 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 C5orf38Q86SI9 138 aa14.74□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.74□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 LYRM7Q5U5X0 104 aa14.74□□□□□ -0.05
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SNRNP25-201ENST00000293861 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.72□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.72□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 REG3AQ06141 175 aa14.72□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 DAND5Q8N907 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SNRNP25-201ENST00000293861 ERG28Q9UKR5 140 aa14.72□□□□□ -0.05
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SNRNP25-201ENST00000293861 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.71□□□□□ -0.05
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SNRNP25-201ENST00000293861 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.7□□□□□ -0.06
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SNRNP25-201ENST00000293861 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.68□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 Q8IZM0 81 aa14.68□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 F8W1H4 67 aa14.67□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 PRR34Q9NV39 138 aa14.67□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa14.66□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNRNP25-201ENST00000293861 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.66□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.65□□□□□ -0.06
SNRNP25-201ENST00000293861 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.65□□□□□ -0.06
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