RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637239.2

TCF4-285, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 7,771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-285	ENST00000637239	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		A4D1N5	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	DEFB1	P60022	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	LELP1	Q5T871	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		A0A0J9YXV3	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	PSMB8	P28062	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		Q6ZTI0	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TCL1B	O95988	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		K7EQG2	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	FXYD2	P54710	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		Q6ZUT4	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	RBX1	P62877	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		E7EUB6	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	LECT2	O14960	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CRYGB	P07316	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		J3QL48	77 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		A0A0U1RQV1	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		K7ERS5	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	PDE6G	P18545	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	UQCRQ	O14949	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	EBI3	Q14213	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		E9PLD3	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CTRL	P40313	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239		Q6ZSR3	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	POLQ	O75417	2590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-285	ENST00000637239	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	PTH2	Q96A98	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239		A0A096LNI7	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	WISP2	O76076	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	RETN	Q9HD89	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239		H3BT86	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-285	ENST00000637239	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.4 ms