RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 PZPP20742 1482 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 EFCAB10A6NFE3 127 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00587B1AMM8 73 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 F8VRH5 84 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 M0R3E3 92 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 IFITM1P13164 125 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 TPPP2P59282 170 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 BAGE2Q86Y30 109 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 F8P00451 2351 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 KMT2DO14686 5537 aa0.06□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 PAPPAQ13219 1627 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 IGLC7A0M8Q6 106 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 TNFP01375 233 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 S100A1P23297 94 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 COX17Q14061 63 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 Q6JHZ5 121 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 U3KQA8 63 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 PEG3Q9GZU2 1588 aa0.05□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 C10orf71Q711Q0 1435 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SCAPERQ9BY12 1400 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 CHD1O14646 1710 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF292O60281 2723 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM208BQ5VWN6 2430 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A0D9SFI3 127 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 F6UZH7 168 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 UQCR11O14957 56 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SSSCA1O60232 199 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 APOC3P02656 99 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 GNG4P50150 75 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP3R1P63098 170 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.04□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SFT2D2O95562 160 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 GNG11P61952 73 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 SFTA2Q6UW10 78 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM223AQ8IWN6 122 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 Q8IZM0 81 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 GNG8Q9UK08 70 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 NUP188Q5SRE5 1749 aa0.03□□□□□ -2.4
SPTAN1-232ENST00000636483 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP5Q13017 1502 aa0.03□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 PI4KAP42356 2102 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA3Q99758 1704 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM24AA6NFZ4 105 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 I3L2K1 104 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 CORTO00230 105 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 WFDC2Q14508 124 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 SVBPQ8N300 66 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 DPH3P1Q9H4G8 78 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 MANBALQ9NQG1 85 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 HMGXB3Q12766 1538 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa0.02□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 COL7A1Q02388 2944 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 IGLC1P0CG04 106 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 Q0VG73 95 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR7Q9Y4E6 1490 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM135AQ9P2D6 1515 aa0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 TSC2P49815 1807 aa0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 CACNA1CQ13936 2221 aa0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM203Q969S6 136 aa0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 CACNA1AO00555 2505 aa-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 MGPP08493 103 aa-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 S100A3P33764 101 aa-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 SNCAP37840 140 aa-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-0.01□□□□□ -2.41
SPTAN1-232ENST00000636483 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms