RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01545Q5VT33 79 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 Q9UF83 564 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PRO0255Q9UI72 69 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NPSP0C0P6 89 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM141Q96I45 108 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGB3A1Q96QR1 104 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM17AQ99595 171 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 Q9H8V8 135 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MYCBP2O75592 4640 aa16.52■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 COTL1Q14019 142 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 IGIPA6NJ69 53 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBA4P53673 196 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00694P0DN24 101 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS1P07477 247 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CDPF1Q6NVV7 123 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZN92 141 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 UPK3BQ9BT76 320 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12JA6NER3 117 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE1Q13065 139 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE4Q13068 117 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE5Q13069 117 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE13Q4V321 117 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-216ENST00000628306 ESRGQ1W209 222 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC32Q5I0X7 151 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WX48 190 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ODF1Q14990 250 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C423 109 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 PAX4O43316 350 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 VAMP8Q9BV40 100 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BNG1 76 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 BAALCQ8WXS3 180 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-216ENST00000628306 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
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CAPNS1-216ENST00000628306 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.39■□□□□ 0.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 PKIAP61925 76 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.39■□□□□ 0.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 H0Y8G0 127 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PMVKQ15126 192 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EPM2AB3EWF7 344 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 F8VRH5 84 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 XGP55808 180 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CST9LQ9H4G1 147 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 DPM2O94777 84 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PLNP26678 52 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TSTD3H0UI37 97 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM243Q9BU79 118 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKCP01834 107 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 AMELXQ99217 191 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 VCX2Q9H322 139 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A096LPF7 62 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ATOH7Q8N100 152 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PMCHL2Q9BQD1 86 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM104AQ969W3 186 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA45Q537H7 98 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF6P10767 208 aa16.29■□□□□ 0.2
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