RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 RAB4AP20338 218 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 FCER1GP30273 86 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 C15orf56Q8N910 161 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 NUP35Q8NFH5 326 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 RNF185Q96GF1 192 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 V9GYV3 84 aa7.43□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 CCL25O15444 150 aa7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 MAJINQ3KP22 176 aa7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 ISOC2Q96AB3 205 aa7.42□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 C9JQL5 133 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 CAMPP49913 170 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 COX6A2Q02221 97 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 PEA15Q15121 130 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 NAT8Q9UHE5 227 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.41□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 A0A087WYN8 130 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 ESDP10768 282 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 FOXI1Q12951 378 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 SS18Q15532 418 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.4□□□□□ -1.22
DDB2-208ENST00000614825 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.39□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.39□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.39□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 PPP1R17O96001 155 aa7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 CKS2P33552 79 aa7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 KIR2DL4Q99706 377 aa7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.38□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 OXTP01178 125 aa7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 MALP21145 153 aa7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 NRACQ8N912 160 aa7.37□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 PPP1R2P9O14990 202 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 STPG4Q8N801 248 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 C7orf33Q8WU49 177 aa7.36□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 PHOX2AO14813 284 aa7.35□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 CARD19Q96LW7 228 aa7.35□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 A0A096LNI7 61 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 A0A1B0GW15 77 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 A4D1N5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 D6R8Y8 96 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 F8W036 122 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 COX7A2LO14548 114 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 S100A8P05109 93 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 HBBP68871 147 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 SYCNQ0VAF6 134 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 NDUFA5Q16718 116 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 TMEM18Q96B42 140 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.34□□□□□ -1.23
DDB2-208ENST00000614825 LINC00862A6NCI5 91 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 CLLU1Q5K131 121 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 Q6ZUT4 128 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 C5orf38Q86SI9 138 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 C20orf78Q9BR46 151 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.33□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.32□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 TCAPO15273 167 aa7.32□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 GAGE2BQ13066 116 aa7.32□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 NPYP01303 97 aa7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 Q6ZRU5 148 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 CDIP1Q9H305 208 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.3□□□□□ -1.24
DDB2-208ENST00000614825 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms