RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-30	P01768	117 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-33	P01772	117 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	RBX1	P62877	108 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	TTC32	Q5I0X7	151 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		14.89	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A096LNJ9	63 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		14.88	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026		Q8N976	141 aa		14.87	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	ERAS	Q7Z444	233 aa		14.86	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026		K7EP13	123 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	NPS	P0C0P6	89 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026		Q8N3U1	123 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM141	Q96I45	108 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	TIMM17A	Q99595	171 aa		14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		14.84	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	ATP5L	O75964	103 aa		14.84	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		14.84	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		14.84	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	HERC2	O95714	4834 aa		14.84	□□□□□ -0.03
LTBP4-227	ENST00000600026	IGIP	A6NJ69	53 aa		14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	LEPROTL1	O95214	131 aa		14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	KLK12	Q9UKR0	248 aa		14.83	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZN92	141 aa		14.82	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		14.81	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZUT4	128 aa		14.81	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		14.81	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	CRP	P02741	224 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	FABP4	P15090	132 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	S100A2	P29034	98 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	C6orf223	Q8N319	242 aa		14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	VCX2	Q9H322	139 aa		14.79	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	C5orf52	A6NGY3	159 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		14.78	□□□□□ -0.04
LTBP4-227	ENST00000600026	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	REG3A	Q06141	175 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	UBE2W	Q96B02	151 aa		14.77	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	RTL8C	O15255	209 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM104A	Q969W3	186 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		14.76	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PRSS1	P07477	247 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	BAALC	Q8WXS3	180 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	AMELX	Q99217	191 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PRR34	Q9NV39	138 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	IFITM10	A6NMD0	228 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PMVK	Q15126	192 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	MIA	Q16674	131 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	ENHO	Q6UWT2	76 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	SS18	Q15532	418 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	CCL25	O15444	150 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	RMI2	Q96E14	147 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026		Q9HAA7	133 aa		14.71	□□□□□ -0.05
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	NFE4	Q86UQ8	179 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	CST9L	Q9H4G1	147 aa		14.7	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		14.69	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026		H0Y8G0	127 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		14.68	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	UBE2D1	P51668	147 aa		14.67	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		14.66	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		14.66	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	SEC11A	P67812	179 aa		14.66	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	TM2D2	Q9BX73	214 aa		14.66	□□□□□ -0.06
LTBP4-227	ENST00000600026	COX11	Q9Y6N1	276 aa		14.66	□□□□□ -0.06

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