RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 GAGE4Q13068 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE5Q13069 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE13Q4V321 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 CELA1Q9UNI1 258 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PKD1P98161 4303 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 F8VRH5 84 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 TSTD3H0UI37 97 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DPM2O94777 84 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PMVKQ15126 192 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 C12orf74Q32Q52 190 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 CST9LQ9H4G1 147 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.31□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 NUPR2A6NF83 97 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PAX4O43316 350 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PLNP26678 52 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 FAM104AQ969W3 186 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 AMELXQ99217 191 aa8.3□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 IGKCP01834 107 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GYPEP15421 78 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-217ENST00000583667 SPATA45Q537H7 98 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 ATOH7Q8N100 152 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.28□□□□□ -1.08
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GGA3-217ENST00000583667 VCX2Q9H322 139 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.28□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 IGLC3P0DOY3 106 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 TIRAPP58753 221 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 NFE4Q86UQ8 179 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.27□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 F5H768 121 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 MAJINQ3KP22 176 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.26□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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GGA3-217ENST00000583667 hDV102S1A0JD36 115 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 FGF6P10767 208 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 PRO1933Q9H354 126 aa8.25□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GUV1 79 aa8.24□□□□□ -1.09
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GGA3-217ENST00000583667 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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GGA3-217ENST00000583667 A0A096LPF7 62 aa8.22□□□□□ -1.09
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GGA3-217ENST00000583667 UBE2L6O14933 153 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 COX8AP10176 69 aa8.22□□□□□ -1.09
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GGA3-217ENST00000583667 Q6ZTC4 211 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 TMEM101Q96IK0 257 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-217ENST00000583667 A0A0J9YY99 117 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 UBE2D1P51668 147 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 SEC11AP67812 179 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZUT4 128 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 E9PLD3 99 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 LELP1Q5T871 98 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 C14orf144Q96I85 54 aa8.2□□□□□ -1.1
GGA3-217ENST00000583667 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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