RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576573.1

EIF4A3-208, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4A3, human

TSL 2

Gene EIF4A3, Length 697 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF4A3-208	ENST00000576573	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	SIX6	O95475	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	XCL1	P47992	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573		Q86TA4	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573		A0A1W2PPV4	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573		M0QY20	66 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	CRYGA	P11844	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	GCHFR	P30047	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	USH2A	O75445	5202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	MT1H	P80294	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573		F8WDY8	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	UBE2L6	O14933	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	CCL25	O15444	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	MGP	P08493	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EIF4A3-208	ENST00000576573	FGF6	P10767	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	UBE2G2	P60604	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	PEX7	O00628	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	PLA2G10	O15496	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	APOM	O95445	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	DEFA1	P59665	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	SNAI2	O43623	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573		Q8N377	158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	COTL1	Q14019	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	BCL2L11	O43521	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	UBE2B	P63146	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573		A0A1W2PRE2	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	CENPX	A8MT69	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	ZNF861P	O60384	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	CXorf1	O96002	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	LTA	P01374	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	IL7	P13232	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	NTF3	P20783	257 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	S100A5	P33763	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.53	□□□□□ -1.68
EIF4A3-208	ENST00000576573	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EIF4A3-208	ENST00000576573		M0QXV9	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
EIF4A3-208	ENST00000576573	LYRM1	O43325	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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