RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 H7C1H1 209 aa9.54□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 CKS2P33552 79 aa9.54□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 PRELID3AQ96N28 172 aa9.54□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 CRPP02741 224 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00614P0C842 121 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 PMCHP20382 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 MPV17L2Q567V2 206 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 C12orf57Q99622 126 aa9.53□□□□□ -0.88
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 M0QY20 66 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 HSBP1O75506 76 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 HAMPP81172 84 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 Q5VSD8 79 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N976 141 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 MRAP2Q96G30 205 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.52□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 FAT1Q14517 4588 aa9.51□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.51□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF6BO95407 300 aa9.49□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 FA2HQ7L5A8 372 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.49□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 SMKR1H3BMG3 65 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 FAM229AH3BQW9 127 aa9.48□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R17O96001 155 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 RBX1P62877 108 aa9.48□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.48□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 LINC01546A6NGU7 62 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 C14orf177Q52M58 125 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 Q6ZSA8 131 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.47□□□□□ -0.89
CMTM3-215ENST00000568477 NRACQ8N912 160 aa9.47□□□□□ -0.89
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CMTM3-215ENST00000568477 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 Q8N8P6 123 aa9.45□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf78Q9BR46 151 aa9.45□□□□□ -0.9
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CMTM3-215ENST00000568477 COTL1Q14019 142 aa9.44□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 USP17L23D6RBM5 183 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 LEPROTL1O95214 131 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 SCGB1D1O95968 90 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.43□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 K7EMI3 77 aa9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 UBE2L6O14933 153 aa9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 C3orf79P0CE67 100 aa9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 KRTDAPP60985 99 aa9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 REG3AQ06141 175 aa9.42□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1B0GUV1 79 aa9.41□□□□□ -0.9
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CMTM3-215ENST00000568477 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.41□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.41□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.41□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 FCER1GP30273 86 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 S100A12P80511 92 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 SCXQ7RTU7 201 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.4□□□□□ -0.9
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 A0A096LNJ9 63 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CMTM3-215ENST00000568477 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.39□□□□□ -0.91
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