RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMKR1H3BMG3 65 aa11.07□□□□□ -0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 C20orf78Q9BR46 151 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP5S1Q9NUS5 200 aa11.07□□□□□ -0.64
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.87□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q8N8P6 123 aa10.86□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.86□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM104AQ969W3 186 aa10.86□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFITM10A6NMD0 228 aa10.85□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf48Q96LS8 159 aa10.85□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.84□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.84□□□□□ -0.67
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