RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 TEX261Q6UWH6 196 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 RAB24Q969Q5 203 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 IMMP2LQ96T52 175 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.62□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 FAM168BA1KXE4 195 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 UMAD1C9J7I0 102 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 APCSP02743 223 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2G2P60604 165 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 C2orf48Q96LS8 159 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 TPPP3Q9BW30 176 aa5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 MUC17Q685J3 4493 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 COX7A2LO14548 114 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 MBP02144 154 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ESDP10768 282 aa5.6□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 NCR2O95944 276 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 RAB14P61106 215 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 SPAG11BQ08648 103 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 RNF151Q2KHN1 245 aa5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1B0GV50 99 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 NUPR1O60356 82 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 LTAP01374 205 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1C3P42330 323 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 BLOC1S1P78537 153 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 IFITM2Q01629 132 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA5Q16718 116 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE2EQ4V326 116 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.58□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TEX46H3BTG2 121 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TRGC1P0CF51 173 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 NTF3P20783 257 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 CTAG1AP78358 180 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF726P1Q15940 193 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.57□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 M0R2T5 61 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 FHITP49789 147 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 CLLU1Q5K131 121 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MED9Q9NWA0 146 aa5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 NDUFA1O15239 70 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MT1HP80294 61 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.55□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 FAM74A7A6NL05 159 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 F8WDY8 70 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MRAP2Q96G30 205 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.54□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 CST9LP1Q5W188 147 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 C5orf38Q86SI9 138 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.53□□□□□ -1.52
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00862A6NCI5 91 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 PMCHP20382 165 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 CCL20P78556 96 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.52□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 RAB19A4D1S5 217 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 PAGE4O60829 102 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 LCE2CQ5TA81 110 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 BAGE2Q86Y30 109 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.51□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 XKRY2A2RUG3 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 F2Z2F3 143 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 I3L3M4 83 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 UQCC3Q6UW78 93 aa5.5□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 BCE1O60756 84 aa5.49□□□□□ -1.53
SMAD3-211ENST00000559460 IFNA1P01562 189 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms