RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115	ESD	P10768	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	FOXI1	Q12951	378 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115		C9JQL5	133 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	CCL25	O15444	150 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	FCER1G	P30273	86 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	SS18	Q15532	418 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115		V9GYV3	84 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	MAJIN	Q3KP22	176 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	NUP35	Q8NFH5	326 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	C7orf33	Q8WU49	177 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	VCY	O14598	125 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	PPP1R17	O96001	155 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	ISOC2	Q96AB3	205 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIPC-208	ENST00000557115	ADIRF	Q15847	76 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	PHOX2A	O14813	284 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115		Q6ZRU5	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	STPG4	Q8N801	248 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	CAMP	P49913	170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	NRAC	Q8N912	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	CARD19	Q96LW7	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115		A0A096LNI7	61 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	MAL	P21145	153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CIPC-208	ENST00000557115	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM18	Q96B42	140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	COX7A2L	O14548	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	CKS2	P33552	79 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	SYCN	Q0VAF6	134 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	UQCC3	Q6UW78	93 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115		A0A1B0GW15	77 aa		13.67	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.66	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	S100A8	P05109	93 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CIPC-208	ENST00000557115	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115		F8W036	122 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	TCAP	O15273	167 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	HBB	P68871	147 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115		Q6ZUT4	128 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	TNFRSF6B	O95407	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	C5orf38	Q86SI9	138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115		D6R8Y8	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	APOM	O95445	188 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	MT1HL1	P0DM35	61 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CIPC-208	ENST00000557115	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115	NPY	P01303	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115	PPBP	P02775	128 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115		A0A1B0GXF2	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115	ADCYAP1	P18509	176 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CIPC-208	ENST00000557115	SPAG11B	Q08648	103 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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