RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 VCYO14598 125 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 SLPIP03973 132 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 MT1HL1P0DM35 61 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 ADIRFQ15847 76 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CFAP161Q6P656 301 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 NRACQ8N912 160 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 hDV102S1A0JD36 115 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 LINC00862A6NCI5 91 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 COMMD7Q86VX2 200 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 C15orf56Q8N910 161 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 BTF3L4Q96K17 158 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 PPP1R2P9O14990 202 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 TMEM101Q96IK0 257 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 C20orf78Q9BR46 151 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GXF2 115 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 PANO1I0J062 215 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 CCL25O15444 150 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 S100A8P05109 93 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 FOXI1Q12951 378 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 KIR2DL4Q99706 377 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-221ENST00000550734 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 SMKR1H3BMG3 65 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 TCAPO15273 167 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 CAMPP49913 170 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 UQCC3Q6UW78 93 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 Q6ZRU5 148 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 F8W036 122 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PHOX2AO14813 284 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PPBPP02775 128 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 FCER1GP30273 86 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 HBBP68871 147 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 TNFRSF6BO95407 300 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 CKS2P33552 79 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 XCL1P47992 114 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 SS18Q15532 418 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 NDUFA5Q16718 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 TMEM18Q96B42 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 A0A087WYN8 130 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 TMEM218A2RU14 115 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PRSS47A8MTI9 375 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 D6R8Y8 96 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 COX6A2Q02221 97 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 FAM104AQ969W3 186 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-221ENST00000550734 NPYP01303 97 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 MT-ND4LP03901 98 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 CHTF8P0CG12 524 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 ORMDL3Q8N138 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 COX7A2LO14548 114 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 DPH3Q96FX2 82 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 ADCYAP1P18509 176 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 SYCNQ0VAF6 134 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 Q6ZUT4 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 SEC11CQ9BY50 192 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-221ENST00000550734 C2orf48Q96LS8 159 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms