RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 MRAP2Q96G30 205 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 TSHBP01222 138 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 ESDP10768 282 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 CAMPP49913 170 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 PTTG1IPP53801 180 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 GAS8-AS1O95177 125 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-214ENST00000548849 ISOC2Q96AB3 205 aa10.48□□□□□ -0.73
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CS-214ENST00000548849 ZNF664Q8N3J9 261 aa10.47□□□□□ -0.73
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CS-214ENST00000548849 A0A1W2PNN7 141 aa10.46□□□□□ -0.73
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CS-214ENST00000548849 A8MWL6 223 aa10.45□□□□□ -0.74
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CS-214ENST00000548849 CAMK2N2Q96S95 79 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 COX7A2LO14548 114 aa10.43□□□□□ -0.74
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CS-214ENST00000548849 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 NUP35Q8NFH5 326 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 APOMO95445 188 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 C1orf137Q5JT78 98 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 SLC51BQ86UW2 128 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 RAB4AP20338 218 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 FCER1GP30273 86 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 CEBPGP53567 150 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 CT83Q5H943 113 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-214ENST00000548849 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
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CS-214ENST00000548849 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.39□□□□□ -0.75
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CS-214ENST00000548849 AMN1Q8IY45 258 aa10.39□□□□□ -0.75
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CS-214ENST00000548849 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.35□□□□□ -0.75
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CS-214ENST00000548849 RNF151Q2KHN1 245 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-214ENST00000548849 Q6ZUT4 128 aa10.34□□□□□ -0.75
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CS-214ENST00000548849 BLOC1S1P78537 153 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 TMEM18Q96B42 140 aa10.33□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 LINC01551Q86U37 167 aa10.32□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 IMMP2LQ96T52 175 aa10.31□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 OSTCQ9NRP0 149 aa10.31□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 PPP1R2P9O14990 202 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.3□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 NDUFA1O15239 70 aa10.29□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 F8WDY8 70 aa10.28□□□□□ -0.76
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CS-214ENST00000548849 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-214ENST00000548849 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-214ENST00000548849 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-214ENST00000548849 GAGE2EQ4V326 116 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-214ENST00000548849 C10orf25Q5T742 122 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-214ENST00000548849 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.27□□□□□ -0.77
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