RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384		A0A1W2PRE2	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384		H7C423	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CXCL1	P09341	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTAG1A	P78358	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SS18	Q15532	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384		H0YIZ8	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	COX7A2L	O14548	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	LTA	P01374	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	NTF3	P20783	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTP4A2-208	ENST00000524384	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	CENPX	A8MT69	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384		M0R2T5	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	CXorf1	O96002	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2G1	P62253	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUPR1	O60356	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384		G3V3Q6	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	NCR2	O95944	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	APCS	P02743	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2G2	P60604	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	SIX6	O95475	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	S100A5	P33763	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384		A0A1B0GVG6	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384		F8WDY8	70 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	NDUFA1	O15239	70 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTP4A2-208	ENST00000524384	BCE1	O60756	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	MB	P02144	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTRL	P40313	264 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	PLA2G10	O15496	165 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRIAP1	O43715	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	AKR1C3	P42330	323 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	LYRM1	O43325	122 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL7	P13232	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	SERF2	P84101	59 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTP4A2-208	ENST00000524384	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms