RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	RNF183	Q96D59	192 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681		Q6YL49	198 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681	APC	P25054	2843 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.65	□□□□□ -0.22
MIB2-231	ENST00000518681		A0A096LNT2	108 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	C2orf82	Q6UX34	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	MIA	Q16674	131 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681		Q9H8V8	135 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681		H7C423	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681		Q6ZTI0	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE4	Q13068	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE5	Q13069	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	CR1	P17927	2039 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	INS	P01308	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MIB2-231	ENST00000518681	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	DSCR9	P59020	149 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681		Q96MF0	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	SNCG	O76070	127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	STH	Q8IWL8	128 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681		Q8N2B8	174 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	COX6C	P09669	75 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681		J3QLI3	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM262	E9PQX1	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE2E	Q4V326	116 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		13.52	□□□□□ -0.24
MIB2-231	ENST00000518681	RS1	O15537	224 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE7	O76087	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	FSHB	P01225	129 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	CITED1	Q99966	193 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681		B5MCH6	92 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	NDUFA1	O15239	70 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	HIVEP2	P31629	2446 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	LST1	O00453	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681		A8MTW9	85 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-231	ENST00000518681		K7EQD1	137 aa		13.46	□□□□□ -0.26
MIB2-231	ENST00000518681	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-231	ENST00000518681	GAGE6	Q13070	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-231	ENST00000518681	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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