RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495663.1

RAB11FIP3-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RAB11FIP3, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.85□□□□□ -1.31
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 M0R2N4 97 aa6.85□□□□□ -1.31
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3-33P01772 117 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 H7C423 109 aa6.84□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ESDP10768 282 aa6.84□□□□□ -1.31
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RAB5AP20339 215 aa6.84□□□□□ -1.31
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 K7EMI3 77 aa6.83□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MPV17L2Q567V2 206 aa6.83□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 RBX1P62877 108 aa6.82□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.82□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.82□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 FGF6P10767 208 aa6.81□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 LAGE3Q14657 143 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.81□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KLK12Q9UKR0 248 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KMT2AQ03164 3969 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 G0S2P27469 103 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FA2HQ7L5A8 372 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.79□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 CRPP02741 224 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RAB5BP61020 215 aa6.79□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 UBE2WQ96B02 151 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q9HAA7 133 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.77□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.77□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RMI2Q96E14 147 aa6.77□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.77□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRR34Q9NV39 138 aa6.77□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC01549A6NIU2 74 aa6.76□□□□□ -1.33
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RAB11FIP3-211ENST00000495663 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ENHOQ6UWT2 76 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BAGE3Q86Y29 109 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.76□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.75□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TOMM6Q96B49 74 aa6.75□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.75□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TM2D2Q9BX73 214 aa6.75□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RTL8CO15255 209 aa6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PSCAO43653 123 aa6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q6ZUT4 128 aa6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.73□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.73□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HIST1H2BKO60814 126 aa6.73□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HSBP1O75506 76 aa6.73□□□□□ -1.33
RAB11FIP3-211ENST00000495663 HBDP02042 147 aa6.73□□□□□ -1.33
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