RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	PMCH	P20382	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		H7C423	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		K7EN84	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	NCR2	O95944	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		A0A087WYN8	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	PANO1	I0J062	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		I3L3M4	83 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	FGF6	P10767	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1B0GUT8	65 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	PRY	O14603	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	COX6A2	Q02221	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	XCL1	P47992	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	SS18	Q15532	418 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZRU5	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	CCL25	O15444	150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	FCER1G	P30273	86 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	STPG4	Q8N801	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RBM39-238	ENST00000493853	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	VCY	O14598	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	PHOX2A	O14813	284 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	PPP1R17	O96001	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	RIG	Q13278	110 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TSHB	P01222	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	RAB4A	P20338	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	NRAC	Q8N912	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	ESD	P10768	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853		A0A096LNI7	61 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	COX7A2L	O14548	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM39-238	ENST00000493853	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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