RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2T35Q8NGX2 323 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53RKQ96S44 253 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PDCD10Q9BUL8 212 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 COMMD5Q9GZQ3 224 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf1Q9H5F2 150 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MED9Q9NWA0 146 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFSF18Q9UNG2 199 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMM9Q9Y5J7 89 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ALG5Q9Y673 324 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MEIS3P1A6NDR6 274 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM9A6NGZ8 99 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 C17orf112F2Z3M2 114 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 G3V3Q6 166 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA7P01567 189 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TPT1P13693 172 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 CXCL2P19875 107 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SNCAP37840 140 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LPAR6P43657 344 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 CCL18P55774 89 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 FXYD4P59646 89 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB2AP61019 212 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB31Q13636 194 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PDE6HQ13956 83 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA5Q16718 116 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RRN3P1Q2M238 152 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf194Q5T5A4 169 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10P1Q8NGE3 313 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4B1Q8NGF8 309 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10D4PQ8NGN7 298 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4X1Q8NH49 305 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LHFPL5Q8TAF8 219 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 DTD1Q8TEA8 209 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM12Q96EX1 92 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01600Q96MT4 127 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PFDN5Q99471 154 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TRGV9Q99603 122 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00467Q9BRT7 94 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PBDC1Q9BVG4 233 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 NPVFQ9HCQ7 196 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ENY2Q9NPA8 101 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPB11Q9Y547 144 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB19A4D1S5 217 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM189A5PLL7 270 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNA5P01569 189 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5G1P05496 136 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFA4P12838 97 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 CXCL3P19876 107 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL12P30050 165 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPOP30536 169 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5G3P48201 142 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMB3P49720 205 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1A2P50226 295 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R45P59539 299 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PSG9Q00887 426 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF90Q03938 601 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 GUK1Q16774 197 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX261Q6UWH6 196 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXI2Q6ZQN5 318 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf62Q8N4C0 152 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 GINS3Q9BRX5 216 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM147Q9BVK8 224 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 UQCC1Q9NVA1 299 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 PSENENQ9NZ42 101 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GW15 77 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PRE2 83 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 CEBPZOSA8MTT3 80 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM25EA8MYX2 175 aa1.3□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM250H0YL14 139 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BNG1 76 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SMLR1H3BR10 107 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC17A3O00476 420 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 ARPC5O15511 151 aa1.3□□□□□ -2.2
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RABGGTB-211ENST00000489450 ADAP1O75689 374 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A9P06702 114 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 NMBP08949 121 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5G3P0C626 314 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SFTA3P0C7M3 94 aa1.3□□□□□ -2.2
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