RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	DPM2	O94777	84 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	CCL25	O15444	150 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	IGKC	P01834	107 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	SEC11A	P67812	179 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	TENM3	Q9P273	2699 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218		H0Y8G0	127 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	NFE4	Q86UQ8	179 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RPS18-231	ENST00000472218	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	TCTA	P57738	103 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	GAGE6	Q13070	117 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218		Q6ZUT4	128 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	TG	P01266	2768 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	NUPR2	A6NF83	97 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	TSTD3	H0UI37	97 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	UBE2D1	P51668	147 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	RBX1	P62877	108 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	HERVK_113	P63121	156 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	CCL18	P55774	89 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	HERVK_113	P61574	105 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	ATOH7	Q8N100	152 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218		H3BRM9	83 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218		K7EP13	123 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	ESRG	Q1W209	222 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218		E9PLD3	99 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	DLEU1	O43261	78 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0J9YXV3	536 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	IGLL5	B9A064	214 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	PRR34	Q9NV39	138 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM223	A0PJW6	202 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	COX8A	P10176	69 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	SS18	Q15532	418 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	STPG4	Q8N801	248 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	REG3A	Q06141	175 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	MIA	Q16674	131 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	APLN	Q9ULZ1	77 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LEPROT	O15243	131 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	SIVA1	O15304	175 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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