RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 KIR2DL4Q99706 377 aa5.96□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 EPM2AB3EWF7 344 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 PPBPP02775 128 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZSA8 131 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.95□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 PHOX2AO14813 284 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 NPYP01303 97 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 COMMD7Q86VX2 200 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 ORMDL3Q8N138 153 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.94□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 hDV102S1A0JD36 115 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 TCAPO15273 167 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 TMEM18Q96B42 140 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 PRELID3AQ96N28 172 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 IMMP2LQ96T52 175 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SEC11CQ9BY50 192 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CCL25O15444 150 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SLPIP03973 132 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 XCL1P47992 114 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 FOXI1Q12951 378 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SS18Q15532 418 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 Q5VSD8 79 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CFAP161Q6P656 301 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 C15orf56Q8N910 161 aa5.92□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 PRSS47A8MTI9 375 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 FAM229AH3BQW9 127 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 FAT1Q14517 4588 aa5.91□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 RAB5AP20339 215 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 SCXQ7RTU7 201 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.9□□□□□ -1.46
SYN3-211ENST00000472027 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZUT4 128 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.89□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 S100PP25815 95 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 Q8N8P6 123 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 FAM104AQ969W3 186 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 PANO1I0J062 215 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 RHEBQ15382 184 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.86□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 K7EMI3 77 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 COX7A2LO14548 114 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 MALP21145 153 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 COX6A2Q02221 97 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 C5orf38Q86SI9 138 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 DPH3Q96FX2 82 aa5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 IFITM10A6NMD0 228 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 APOC3P02656 99 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 CHTF8P0CG12 524 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 COX19Q49B96 90 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.84□□□□□ -1.47
SYN3-211ENST00000472027 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.84□□□□□ -1.47
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