RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 CXCL1P09341 107 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 GCHFRP30047 84 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2AP49459 152 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf25Q5T742 122 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 C22orf24Q9Y442 160 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 PEX7O00628 323 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 STAG3L2P0CL84 134 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 STAG3L3P0CL85 134 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2G1P62253 170 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 PYDC2Q56P42 97 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-211ENST00000463372 A0A087WXM4 84 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 ATP6V1G2O95670 118 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PRE2 83 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 SPINK1P00995 79 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 FMC1Q96HJ9 113 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 IL15RAQ13261 267 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 RAB24Q969Q5 203 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 CXorf1O96002 111 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 LTAP01374 205 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 TPPP3Q9BW30 176 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 Q8NBF4 154 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 MRAP2Q96G30 205 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2G2P60604 165 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-211ENST00000463372 TRGC1P0CF51 173 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 PMCHP20382 165 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 Q6Q795 121 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 I3L3M4 83 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A20O43772 301 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N377 158 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 GATD1Q8NB37 220 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00167Q96N53 147 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 HSPB11Q9Y547 144 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF727A8MUV8 499 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 PRLHP81277 87 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-211ENST00000463372 FAM74A7A6NL05 159 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 UPK1BO75841 260 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 GAGE10A6NGK3 116 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 CENPXA8MT69 81 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 MT2AP02795 61 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 AKR1C3P42330 323 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 DEFA1P59665 94 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 C2orf82Q6UX34 121 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 V9GYH0 126 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf92A6NGG3 77 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 IGLC6P0CF74 106 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC32Q9BV29 185 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 H0YIZ8 118 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 MBP02144 154 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 BTCP35070 178 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 STOML3Q8TAV4 291 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 F2Z2F3 143 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 KIAA0087Q14695 138 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-211ENST00000463372 TRIQKQ629K1 86 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms