RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N976 141 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TENM2Q9NT68 2774 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGIPA6NJ69 53 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 LEPROTL1O95214 131 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 KLK12Q9UKR0 248 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CRPP02741 224 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A2P29034 98 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 VCX2Q9H322 139 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf52A6NGY3 159 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 FABP4P15090 132 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZUT4 128 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N3U1 123 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL25O15444 150 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS1P07477 247 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 REG3AQ06141 175 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2WQ96B02 151 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 AMELXQ99217 191 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR34Q9NV39 138 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE6AA0A183 80 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IFITM10A6NMD0 228 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PMVKQ15126 192 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 SS18Q15532 418 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MIAQ16674 131 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 BAALCQ8WXS3 180 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM104AQ969W3 186 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 RMI2Q96E14 147 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC11AP67812 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 ENHOQ6UWT2 76 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 NFE4Q86UQ8 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CST9LQ9H4G1 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 COX11Q9Y6N1 276 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2N4 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZR54 194 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 TM2D2Q9BX73 214 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2D1P51668 147 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 Q9HAA7 133 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y8G0 127 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTDAPP60985 99 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 PET117Q6UWS5 81 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf202A1L168 122 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 C3orf79P0CE67 100 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 XCL1P47992 114 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 HERVK_113P63121 156 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf223Q8N319 242 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0J9YXV3 536 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 F8VRH5 84 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 PSCAO43653 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLC3P0DOY3 106 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 AKR1D1P51857 326 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 ODF1Q14990 250 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-208ENST00000462602 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.27□□□□□ -1.4
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