RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE6Q13070 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PRR34Q9NV39 138 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.34□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 HSBP1O75506 76 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZR54 194 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N976 141 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM18Q96B42 140 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 C5orf52A6NGY3 159 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-30P01768 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-33P01772 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 PMCHL1Q16048 86 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZUT4 128 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 ERASQ7Z444 233 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 NFE4Q86UQ8 179 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf223Q8N319 242 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 AMELXQ99217 191 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IFITM10A6NMD0 228 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 CRPP02741 224 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA6P56556 154 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM141Q96I45 108 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 RMI2Q96E14 147 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5LO75964 103 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 ENHOQ6UWT2 76 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 BAALCQ8WXS3 180 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM101Q96IK0 257 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 PSCAO43653 123 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 LEPROTL1O95214 131 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 REG3AQ06141 175 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TM2D2Q9BX73 214 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 Q9HAA7 133 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 KLK12Q9UKR0 248 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 COX11Q9Y6N1 276 aa6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A6P06703 90 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2D1P51668 147 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 MIAQ16674 131 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2WQ96B02 151 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 EREGO14944 169 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 CCL25O15444 150 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 PMVKQ15126 192 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 CST9LQ9H4G1 147 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 ODF1Q14990 250 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZN92 141 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 VCX2Q9H322 139 aa6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLC3P0DOY3 106 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4-207ENST00000454947 RTL8CO15255 209 aa6.23□□□□□ -1.41
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