RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TSHBP01222 138 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 STPG4Q8N801 248 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM101Q96IK0 257 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 BTF3L4Q96K17 158 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 ST20Q9HBF5 79 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A096LNI7 61 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL25O15444 150 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 ESDP10768 282 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 CT83Q5H943 113 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 BORCS7Q96B45 105 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 MRAP2Q96G30 205 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GUT8 65 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 HIGD1CA8MV81 97 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 TSKUQ8WUA8 353 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD19Q96LW7 228 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SMKR1H3BMG3 65 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB4AP20338 218 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SS18Q15532 418 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC01551Q86U37 167 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 AMN1Q8IY45 258 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCNQ0VAF6 134 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 ODF1Q14990 250 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 OSTCQ9NRP0 149 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF727A8MUV8 499 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 VCYO14598 125 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 FCER1GP30273 86 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC01600Q96MT4 127 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM210AQ96ND0 272 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 COX7A2LO14548 114 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 MALP21145 153 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMPP49913 170 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE2BQ13066 116 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 RIGQ13278 110 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP35Q8NFH5 326 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 V9GYV3 84 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 PTTG1IPP53801 180 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 NRACQ8N912 160 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF213Q63HN8 5207 aa6.4□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0J9YXV3 536 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R17O96001 155 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZRP5 223 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 ISOC2Q96AB3 205 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 REG3GQ6UW15 175 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZUT4 128 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 C5orf38Q86SI9 138 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 KIR2DL4Q99706 377 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PNN7 141 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 APOMO95445 188 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP10-8P60410 259 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 ADIRFQ15847 76 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf48Q96LS8 159 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R2P9O14990 202 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 CKS2P33552 79 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.35□□□□□ -1.39
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