RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 IMMP2LQ96T52 175 aa6.9□□□□□ -1.3
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DDX39B-209ENST00000428450 MT-ND6P03923 174 aa6.89□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 ATP6V0CP27449 155 aa6.89□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.89□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.86□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM18Q96B42 140 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.86□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 AMTP48728 403 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 NAT8Q9UHE5 227 aa6.85□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 ESDP10768 282 aa6.84□□□□□ -1.31
DDX39B-209ENST00000428450 FOXI1Q12951 378 aa6.84□□□□□ -1.31
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DDX39B-209ENST00000428450 TSPAN13O95857 204 aa6.83□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1W2PRE2 83 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 M0QY20 66 aa6.82□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 UBE2D1P51668 147 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.82□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 PRO1933Q9H354 126 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.82□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 PEX7O00628 323 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 SNAI2O43623 268 aa6.81□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 SYCNQ0VAF6 134 aa6.81□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.8□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 MBP02144 154 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.79□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 OR5AL1P0C617 328 aa6.78□□□□□ -1.32
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DDX39B-209ENST00000428450 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.78□□□□□ -1.32
DDX39B-209ENST00000428450 A0A087WZ39 114 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 LTAP01374 205 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 SMIM17P0DL12 118 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 FGF6P10767 208 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 XCL1P47992 114 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF726P1Q15940 193 aa6.77□□□□□ -1.33
DDX39B-209ENST00000428450 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.77□□□□□ -1.33
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