RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf132Q9NPU4 83 aa15.05■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA25Q9BR10 227 aa15.05■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa15.05■□□□□ 0
CCSAP-203ENST00000366687 G3V4G9 280 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 B9D2Q9BPU9 175 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 CRYGDP07320 174 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01006Q8NI28 216 aa15.05■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.04■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.04■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 YPEL4Q96NS1 127 aa15.04■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N976 141 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.03■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 KLLNB2CW77 178 aa15.02■□□□□ -0
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV1-40P01703 118 aa15.02□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PROK1P58294 105 aa15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 SS18L2Q9UHA2 77 aa15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.01□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 HCFC1P51610 2035 aa15□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 RBX1P62877 108 aa14.99□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.99□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 BPY2O14599 106 aa14.99□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.99□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 NRACQ8N912 160 aa14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 H0Y9J4 135 aa14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 LY6G6DO95868 133 aa14.98□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 RNF183Q96D59 192 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf47Q569G3 176 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 PRR9Q5T870 116 aa14.97□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.96□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 Q6ZS46 218 aa14.96□□□□□ -0.01
CCSAP-203ENST00000366687 TSHBP01222 138 aa14.95□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 SYCNQ0VAF6 134 aa14.95□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 DCANP1Q8TF63 244 aa14.95□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.95□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf85Q96MD7 179 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 CDSNQ15517 529 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.94□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM17BO60830 172 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.93□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 TRIAP1O43715 76 aa14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.92□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 CNFNQ9BYD5 112 aa14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf99Q4VX62 202 aa14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WZ39 114 aa14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 UPK3BQ9BT76 320 aa14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.9□□□□□ -0.02
CCSAP-203ENST00000366687 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 J3KT08 172 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 AVPP01185 164 aa14.89□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.88□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 LRRK2Q5S007 2527 aa14.88□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 LELP1Q5T871 98 aa14.88□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 A0A096LNI7 61 aa14.88□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 SLPIP03973 132 aa14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.87□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 A8MZ25 164 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.86□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.85□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.85□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.84□□□□□ -0.03
CCSAP-203ENST00000366687 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 GAS8-AS1O95177 125 aa14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 PRM2P04554 102 aa14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.82□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.82□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ATP8P03928 68 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2D3P61077 147 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2D2P62837 147 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2D1P51668 147 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.81□□□□□ -0.04
CCSAP-203ENST00000366687 IGKV4-1P06312 121 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms