RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 PRR4Q16378 134 aa11.99□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 SPRY4Q9C004 299 aa11.99□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 Q6YL49 198 aa11.98□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 P0C879 139 aa11.98□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 Q8NA96 180 aa11.98□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 C7orf33Q8WU49 177 aa11.98□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 PRO3102Q9H379 93 aa11.98□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 A8MZ25 164 aa11.97□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.97□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.97□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 M0QY20 66 aa11.97□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 LINC00526Q96FQ7 95 aa11.96□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.96□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 LY6LH3BQJ8 138 aa11.96□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 A6NED7 52 aa11.96□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.96□□□□□ -0.49
RXRA-201ENST00000356384 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.96□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 V9GYY9 64 aa11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 UBE2D1P51668 147 aa11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 C9orf85Q96MD7 179 aa11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZQY7 126 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 Q8N9L7 120 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 MIFP14174 115 aa11.94□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 CACNA1AO00555 2505 aa11.93□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.93□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 CRIP1P50238 77 aa11.92□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 M0R2N4 97 aa11.92□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 RNF185Q96GF1 192 aa11.92□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 RBX1P62877 108 aa11.92□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 C10orf99Q6UWK7 81 aa11.91□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 MBD6Q96DN6 1003 aa11.91□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 SORL1Q92673 2214 aa11.91□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 SERP2Q8N6R1 65 aa11.91□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.9□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.9□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 LINC00574Q9H8X3 128 aa11.9□□□□□ -0.5
RXRA-201ENST00000356384 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.9□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 M0R378 163 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZSV7 163 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 NDUFC1O43677 76 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 NDUFA7O95182 113 aa11.89□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 PRORYQ9H606 182 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 UBE2D3P61077 147 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 TIMM17BO60830 172 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.88□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 Q6ZPA2 131 aa11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 U3KQK5 164 aa11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 PTPRSQ13332 1948 aa11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.87□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 TECTAO75443 2155 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 TSHBP01222 138 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.86□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa11.85□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.85□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.85□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.85□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.84□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.84□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.84□□□□□ -0.51
RXRA-201ENST00000356384 LST1O00453 97 aa11.83□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.83□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.83□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.83□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 CCDC179H3BU77 68 aa11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 UTRNP46939 3433 aa11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 PRM2P04554 102 aa11.82□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 ZNF843Q8N446 348 aa11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 LELP1Q5T871 98 aa11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 IMUPQ9GZP8 106 aa11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 EBI3Q14213 229 aa11.81□□□□□ -0.52
RXRA-201ENST00000356384 NRACQ8N912 160 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103 ms