RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PKIAP61925 76 aa15.14■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 LYSTQ99698 3801 aa15.14■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 A0A087WX48 190 aa15.13■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 RBX1P62877 108 aa15.13■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 Q8N976 141 aa15.13■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 BAALCQ8WXS3 180 aa15.13■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 FAM104AQ969W3 186 aa15.13■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZUT4 128 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 VCX2Q9H322 139 aa15.12■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 AKR1D1P51857 326 aa15.11■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.11■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 Q8N3U1 123 aa15.11■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.1■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 TENM2Q9NT68 2774 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 PMVKQ15126 192 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 TEX43Q6ZNM6 134 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 AMELXQ99217 191 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 UPK3BQ9BT76 320 aa15.09■□□□□ 0.01
CTU2-201ENST00000312060 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3-30P01768 117 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3-33P01772 117 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 PET117Q6UWS5 81 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.08■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa15.07■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 CST9LQ9H4G1 147 aa15.07■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 C3orf84H3BNL1 204 aa15.06■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 SIVA1O15304 175 aa15.06■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 CASC10Q5T4H9 136 aa15.06■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.06■□□□□ 0
CTU2-201ENST00000312060 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.05■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.05■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 ODF1Q14990 250 aa15.04■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 Q9H8V8 135 aa15.04■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 KLK12Q9UKR0 248 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 SCGB1D1O95968 90 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 LINC01545Q5VT33 79 aa15.03■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.02■□□□□ -0
CTU2-201ENST00000312060 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.01□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 C20orf202A1L168 122 aa15.01□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.01□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 F8VRH5 84 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 UBE2D1P51668 147 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 REG3AQ06141 175 aa15□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.99□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 PYY3Q5JQD4 70 aa14.98□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 A0A0J9YXV3 536 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 PRR34Q9NV39 138 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 UBE2WQ96B02 151 aa14.97□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 DPM2O94777 84 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 CRPP02741 224 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 ENHOQ6UWT2 76 aa14.96□□□□□ -0.01
CTU2-201ENST00000312060 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.95□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 IGKCP01834 107 aa14.95□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 SS18Q15532 418 aa14.95□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 IGLC3P0DOY3 106 aa14.94□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.94□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.94□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 C11orf86A6NJI1 115 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 PLNP26678 52 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 SEC11AP67812 179 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 ATOH7Q8N100 152 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 CCL25O15444 150 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 NFE4Q86UQ8 179 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 K7EP13 123 aa14.92□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.91□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.91□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 COX6A2Q02221 97 aa14.91□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 MIAQ16674 131 aa14.91□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 HERVK_113P63121 156 aa14.9□□□□□ -0.02
CTU2-201ENST00000312060 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.89□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 XCL1P47992 114 aa14.89□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.88□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.88□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.87□□□□□ -0.03
CTU2-201ENST00000312060 LY6G6CO95867 125 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms