RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 EMP1P54849 157 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 GAGE5Q13069 117 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 GAGE6Q13070 117 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 CEND1Q8N111 149 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 B9D2Q9BPU9 175 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 NACAE9PAV3 2078 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 FXYD2P54710 66 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 TAL2Q16559 108 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 CDIP1Q9H305 208 aa11.37□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 ETDBQ3ZM63 59 aa11.36□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 RHODO00212 210 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 RS1O15537 224 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 SPINK8P0C7L1 97 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 GAGE13Q4V321 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 Q9UF83 564 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLL5B9A064 214 aa11.35□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 HERVK_113P61574 105 aa11.34□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.34□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.34□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF183Q96D59 192 aa11.34□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 VCX2Q9H322 139 aa11.34□□□□□ -0.59
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-53P01767 116 aa11.33□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 HIST1H4GQ99525 98 aa11.33□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXI1Q12951 378 aa11.33□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.33□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.33□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa11.32□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF815PA8K554 130 aa11.32□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 NFE4Q86UQ8 179 aa11.32□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.32□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa11.32□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZUT4 128 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 RETNQ9HD89 108 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TGP01266 2768 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17DQ8TAD2 202 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 COL7A1Q02388 2944 aa11.31□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.3□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BMG7 143 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 APOC4P55056 127 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 APOMO95445 188 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.29□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 K7ERJ3 54 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 MT-ATP8P03928 68 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB135Q30KP9 77 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM104AQ969W3 186 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 AMELXQ99217 191 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 CHCHD7Q9BUK0 85 aa11.28□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0J9YXV3 536 aa11.27□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GWB2 263 aa11.27□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 HERV-K104P63124 156 aa11.27□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
TSNARE1-201ENST00000307180 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RRN3P1Q2M238 152 aa11.27□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 C12orf74Q32Q52 190 aa11.27□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.27□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.26□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM223A0PJW6 202 aa11.26□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 XGP55808 180 aa11.26□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.26□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZTI0 123 aa11.26□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 J3QQQ9 107 aa11.25□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 LEPROTO15243 131 aa11.25□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0J9YY99 117 aa11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa11.24□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 B5MCH6 92 aa11.22□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.22□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf74Q96GX8 76 aa11.22□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TENM3Q9P273 2699 aa11.22□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.21□□□□□ -0.61
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.21□□□□□ -0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.21□□□□□ -0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM262E9PQX1 116 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms