RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR4Q16378 134 aa8.83□□□□□ -1
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UBASH3B-201ENST00000284273 WFDC2Q14508 124 aa8.82□□□□□ -1
UBASH3B-201ENST00000284273 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
UBASH3B-201ENST00000284273 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.82□□□□□ -1
UBASH3B-201ENST00000284273 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.82□□□□□ -1
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UBASH3B-201ENST00000284273 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.82□□□□□ -1
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UBASH3B-201ENST00000284273 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
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UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf137Q5JT78 98 aa8.75□□□□□ -1.01
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.75□□□□□ -1.01
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UBASH3B-201ENST00000284273 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.71□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.7□□□□□ -1.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 TEN1Q86WV5 123 aa8.7□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 LELP1Q5T871 98 aa8.7□□□□□ -1.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 HCFC1P51610 2035 aa8.69□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.69□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.69□□□□□ -1.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZQY7 126 aa8.67□□□□□ -1.02
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UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.67□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.66□□□□□ -1.02
UBASH3B-201ENST00000284273 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.66□□□□□ -1.02
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