RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.1■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 ACANP16112 2415 aa16.1■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.09■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 J3QKU1 62 aa16.09■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.09■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 EDN2P20800 178 aa16.09■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 DCANP1Q8TF63 244 aa16.08■□□□□ 0.17
USP12-201ENST00000282344 LINC00308Q8TCZ7 52 aa16.08■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 CHD9Q3L8U1 2897 aa16.08■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 C14orf132Q9NPU4 83 aa16.08■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 Q6YL49 198 aa16.07■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 A0A1W2PPR1 153 aa16.07■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 CFAP54Q96N23 3096 aa16.07■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 ZNF462Q96JM2 2506 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 DEFB105AQ8NG35 78 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 NCR3O14931 201 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 SPANXCQ9NY87 97 aa16.06■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 IGIPA6NJ69 53 aa16.05■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 SPART-AS1P0CW21 52 aa16.05■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 KLK12Q9UKR0 248 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 ATOX1O00244 68 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 LINC00643Q86TS7 51 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 C9orf85Q96MD7 179 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 PRO0255Q9UI72 69 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa16.04■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 AVPP01185 164 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 SPAG11BQ08648 103 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 PTPRBP23467 1997 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 IGLV1-40P01703 118 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 COX8CQ7Z4L0 72 aa16.03■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.02■□□□□ 0.16
USP12-201ENST00000282344 C18orf65Q6ZTR6 163 aa16.02■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 FASNP49327 2511 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.02■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.01■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 XGP55808 180 aa16.01■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 PRORYQ9H606 182 aa16.01■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 NDUFA1O15239 70 aa15.99■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa15.99■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 TIRAPP58753 221 aa15.99■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.98■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.98■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.97■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 Q6ZSV7 163 aa15.97■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 SPATA25Q9BR10 227 aa15.97■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 hADV29S1A0JD25 119 aa15.96■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 SLPIP03973 132 aa15.96■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.96■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 CITED1Q99966 193 aa15.96■□□□□ 0.15
USP12-201ENST00000282344 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.96■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 UBE2D1P51668 147 aa15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 RBM3P98179 157 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 ZNF702PQ9H963 129 aa15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.95■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.94■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 CXCL5P42830 114 aa15.94■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.93■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.93■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.93■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.92■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa15.92■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 ZNF580Q9UK33 172 aa15.91■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 LST1O00453 97 aa15.91■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.9■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 MRAPQ8TCY5 172 aa15.9■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.89■□□□□ 0.14
USP12-201ENST00000282344 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 NDUFA7O95182 113 aa15.89■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.88■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa15.88■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 UBE2BP63146 152 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 REG3AQ06141 175 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 DIRC1Q969H9 104 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 TIMM17BO60830 172 aa15.87■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.86■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 H7C423 109 aa15.86■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 CDK2AP2O75956 126 aa15.86■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 NREPQ16612 68 aa15.85■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.85■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 RMI2Q96E14 147 aa15.85■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 UBE2D3P61077 147 aa15.84■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 UBE2D2P62837 147 aa15.84■□□□□ 0.13
USP12-201ENST00000282344 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms