RNA–Protein interactions for RNA: YPR087W

VPS69, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene VPS69, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS69	YPR087W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CSM3	Q04659	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SGD1	Q06132	899 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SUE1	Q06524	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
VPS69	YPR087W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	APT2	P36973	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	APN2	P38207	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	DUN1	P39009	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	LYS14	P40971	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	IML2	P47031	731 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	FMS1	P50264	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YML037C	Q03703	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	FBP1	P09201	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SWI6	P09959	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	PHO3	P24031	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SED4	P25365	1065 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	DGR2	P32330	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MIC60	P36112	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MRPL10	P36520	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	PPE1	P38796	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	VAB2	P40003	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SDP1	P40479	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YIL089W	P40500	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MND2	P40577	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YFL066C	P43538	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	ASK10	P48361	1146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YGR130C	P53278	816 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NUR1	Q12066	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	FOB1	O13329	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CYC7	P00045	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MSH1	P25846	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	GSY2	P27472	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CDC15	P27636	974 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	DBF20	P32328	564 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	KTR4	P38131	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SUL1	P38359	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NDT80	P38830	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CTF8	P38877	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SAK1	P38990	1142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	QRI7	P43122	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	UBA2	P52488	636 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	LIF1	P53150	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SSL2	Q00578	843 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	MFM1	Q02783	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	AIM33	Q04516	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	COG4	Q06096	861 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SWM1	Q12379	170 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CKA2	P19454	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	TGL1	P34163	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	FAT1	P38225	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YHR202W	P38887	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	GAA1	P39012	614 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	THI6	P41835	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	VTC2	P43585	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	NET1	P47035	1189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CBK1	P53894	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	TEP1	P53916	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	BLS1	Q06071	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SPH1	Q06160	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YLH47	Q06493	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	OMS1	Q06668	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	ARP6	Q12509	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	GAL10	P04397	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	HOP1	P20050	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS69	YPR087W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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