RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	XBP1	P40489	647 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	MAD2	P40958	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	YJL043W	P47053	257 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	PEX14	P53112	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	WAR1	Q03631	944 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	PHM6	Q05637	104 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	SLX4	Q12098	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	EXO1	P39875	702 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	YNR071C	P53757	342 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	CRT10	Q08226	957 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	PSF3	Q12146	194 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPF2	YKR081C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PLC1	P32383	869 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	CDC5	P32562	705 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SDH8	P38345	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	TDA10	P42938	290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	NET1	P47035	1189 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	ATP23	P53722	227 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
RPF2	YKR081C	DIN7	Q12086	430 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	GSY2	P27472	705 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PCL8	Q08966	492 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	YIL092W	P40497	633 aa		5	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	GSM1	P42950	618 aa		5	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	TRI1	Q05024	226 aa		5	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	BEM3	P32873	1128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	COS12	P53053	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	FOL1	P53848	824 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PHO3	P24031	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	TAF5	P38129	798 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	BSP1	Q06604	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SDS22	P36047	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	STB5	P38699	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	BST1	P43571	1029 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	NMD5	P46970	1048 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	YNL092W	P53934	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	NUR1	Q12066	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	FRE7	Q12333	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPF2	YKR081C	SAW1	P39735	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	RAD26	P40352	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	LAS21	P40367	830 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	SNO3	P43544	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	IDS2	P46958	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	RGT2	Q12300	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	GDA1	P32621	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	MAM1	P40065	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	SAE2	P46946	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	STP1	Q00947	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	HRD3	Q05787	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	BI2	P03873	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YLF2	P38746	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	VFA1	P40080	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	SCS3	P53012	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	COG2	P53271	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	TRS31	Q03337	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	RAD33	Q04231	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	ENT2	Q05785	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CYK3	Q07533	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YCR061W	P25639	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	MTG2	P38860	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	LNP1	P38878	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YNL058C	P53947	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	MPS1	P54199	764 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	RSC9	Q03124	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YML119W	Q03208	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	TPO3	Q06451	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CRD1	Q07560	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CTT1	P06115	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	ADH4	P10127	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	AMD2	P22580	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	SWD1	P39706	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	CIR1	P42940	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	POL31	P46957	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.3 ms