RNA–Protein interactions for RNA: YKL137W

CMC1, Transcript of Copper-binding protein of the mitochondrial intermembrane space, yeast

Gene CMC1, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMC1	YKL137W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	NUP1	P20676	1076 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	PHO3	P24031	467 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	LTP1	P40347	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	GSM1	P42950	618 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	YJL043W	P47053	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	DIN7	Q12086	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMC1	YKL137W	MDM10	P18409	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	TGL1	P34163	548 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	SDH8	P38345	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	YFL015C	P43578	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	APN1	P22936	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	PTP1	P25044	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	CDC5	P32562	705 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	EXO1	P39875	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	LAS21	P40367	830 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	IDS2	P46958	469 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	PIP2	P52960	996 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	YNL058C	P53947	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	NUR1	Q12066	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	CTT1	P06115	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	YLF2	P38746	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	LNP1	P38878	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	VFA1	P40080	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	COS12	P53053	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	ATP23	P53722	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	AFT2	Q08957	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	RAD26	P40352	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	TDA10	P42938	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	ASK10	P48361	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	BI2	P03873	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	TOM20	P35180	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	STB5	P38699	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	MAM1	P40065	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	XBP1	P40489	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	CRD1	Q07560	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	MBR1	P23493	339 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	GSY2	P27472	705 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	MTG2	P38860	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	NET1	P47035	1189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	ENT2	Q05785	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	PCL8	Q08966	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	BEM3	P32873	1128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	SNM1	P40993	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	COG2	P53271	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	AAT1	Q01802	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	TRS31	Q03337	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	SND1	Q04007	877 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CMC1	YKL137W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
CMC1	YKL137W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	ADH4	P10127	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	SWD1	P39706	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	CIR1	P42940	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	SNO3	P43544	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	NMD5	P46970	1048 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	GLO1	P50107	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YNL034W	P53963	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	VPS64	Q03944	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	BSP1	Q06604	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	AAD4	Q07747	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	ARP7	Q12406	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	SWC3	P31376	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YKL133C	P36066	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	GRX7	P38068	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	POL31	P46957	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	PEX8	P53248	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	HRD3	Q05787	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YCR061W	P25639	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	GDA1	P32621	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	YNL092W	P53934	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	SEC5	P89102	971 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	ACS1	Q01574	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CMC1	YKL137W	RAD33	Q04231	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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