RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	RHBDL3	P58872	404 aa		32.78	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.78	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	32.78	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		32.78	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	CYP7A1	P22680	504 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.76	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		32.75	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	OTOF	Q9HC10	1997 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ALDH1A1	P00352	501 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	CERS3	Q8IU89	383 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	OTUD5	Q96G74	571 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	GOLIM4	O00461	696 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	PPP4C	P60510	307 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ERO1B	Q86YB8	467 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	GPATCH3	Q96I76	525 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		32.72	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ATP5J	P18859	108 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	AAMP	Q13685	434 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	INPP5B	P32019	993 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	GJA5	P36382	358 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	GTF2A2	P52657	109 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BRD4-208	ENST00000597315	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	IFNL1	Q8IU54	200 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	DOCK2	Q92608	1830 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D8	O95759	1140 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		32.68	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	PPAT	Q06203	517 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	HAUS7	Q99871	368 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82	1e-6	■■■□□ 14.8
BRD4-208	ENST00000597315	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82	2e-7	■□□□□ 9.6
BRD4-208	ENST00000597315	PICK1	Q9NRD5	415 aa		32.66	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	USP5	P45974	858 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	PPIL2	Q13356	520 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	CCL15	Q16663	113 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.64	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
BRD4-208	ENST00000597315	FLT1	P17948	1338 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D12	O60347	775 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CETP	P11597	493 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	PDE6A	P16499	860 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		32.63	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K10	Q02779	954 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	IRF6	O14896	467 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	HLA-DOA	P06340	250 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	GPR25	O00155	361 aa		32.58	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	PALD1	Q9ULE6	856 aa		32.58	■■■□□ 2.81
BRD4-208	ENST00000597315	FAM196B	A6NMK8	535 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ERC2	O15083	957 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	PTPN18	Q99952	460 aa		32.57	■■■□□ 2.8

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