RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 BAG3O95817 575 aa25.4■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.39■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CNDP2-204ENST00000577409 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.39■■□□□ 1.66
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CNDP2-204ENST00000577409 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.38■■□□□ 1.65
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CNDP2-204ENST00000577409 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CNDP2-204ENST00000577409 SPRYD7Q5W111 196 aa25.36■■□□□ 1.65
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CNDP2-204ENST00000577409 MAP3K10Q02779 954 aa25.34■■□□□ 1.65
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CNDP2-204ENST00000577409 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.34■■□□□ 1.65
CNDP2-204ENST00000577409 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.33■■□□□ 1.65
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CNDP2-204ENST00000577409 OPTNQ96CV9 577 aa25.31■■□□□ 1.64
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CNDP2-204ENST00000577409 TBC1D12O60347 775 aa25.28■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 MBD4O95243 580 aa25.28■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 USP5P45974 858 aa25.28■■□□□ 1.64
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CNDP2-204ENST00000577409 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.27■■□□□ 1.64
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CNDP2-204ENST00000577409 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 TM4SF4P48230 202 aa25.27■■□□□ 1.64
CNDP2-204ENST00000577409 RNF186Q9NXI6 227 aa25.27■■□□□ 1.64
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CNDP2-204ENST00000577409 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 DNAJC18Q9H819 358 aa25.26■■□□□ 1.63
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CNDP2-204ENST00000577409 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 ERO1BQ86YB8 467 aa25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 OSBP2Q969R2 916 aa25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
CNDP2-204ENST00000577409 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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