RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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PRPF8-211ENST00000574728 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.8□□□□□ -1.32
PRPF8-211ENST00000574728 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PRPF8-211ENST00000574728 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PRPF8-211ENST00000574728 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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