RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP1BP68106 108 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 CERS3Q8IU89 383 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 LCORLQ8N3X6 602 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMT1Q9H993 441 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASSF10A6NK89 507 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBD4O95243 580 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 RILPL2Q969X0 211 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 SKAP1Q86WV1 359 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLT1P17948 1338 aa25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP5P45974 858 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSRNP1Q96S65 589 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 APPBP2Q92624 585 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSBP2Q969R2 916 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH1P12882 1939 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRM1Q13255 1194 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 AIDAQ96BJ3 306 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOOK2Q96ED9 719 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLURP2P0DP57 97 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC22Q5TAA0 569 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTOFQ9HC10 1997 aa25.24■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKAB2O43741 272 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K11Q16584 847 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 PALD1Q9ULE6 856 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 M0R2C6 588 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 VEGFBP49765 207 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF15Q66K64 600 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGMBQ6NW40 437 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRG1Q96E93 195 aa25.23■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAPNS2Q96L46 248 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIPA1L1O43166 1804 aa25.2■■□□□ 1.63
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 WRNIP1Q96S55 665 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM196BA6NMK8 535 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPAA1O43292 621 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 SDSP20132 328 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECE1P42892 770 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K9P80192 1104 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM227BQ96M60 508 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCNTO95613 3336 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K10Q02779 954 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 AOC2O75106 756 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 INPP5BP32019 993 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 VGLL4Q14135 290 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC102AQ96A19 550 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-208ENST00000566515 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms