RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 MECOMQ03112 1051 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA5Q8NB90 893 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 RAI14Q9P0K7 980 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMC4P43686 418 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 GCC1Q96CN9 775 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRAP18433 802 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K10Q02779 954 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TNNQ9UQP3 1299 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 RAET1EQ8TD07 263 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.381e-7■■■■□ 21.3
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SRRDQ9UH36 339 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D12O60347 775 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 FCGRTP55899 365 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 RHBDL3P58872 404 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 MOGSQ13724 837 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 PI16Q6UXB8 463 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 BAG3O95817 575 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2C8P10632 490 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP8B2P98198 1209 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM47Q96LD4 638 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR108Q9NPR9 543 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM75PA6NK02 468 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBPP22059 807 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 MCAMP43121 646 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 MYPNQ86TC9 1320 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 DOCK2Q92608 1830 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX11Q8IYF3 940 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCG2P16885 1265 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 GRK4P32298 578 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 POLA2Q14181 598 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 TNNI3KQ59H18 835 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SSH3Q8TE77 659 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF384Q8TF68 577 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SNRKQ9NRH2 765 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BP2-220ENST00000511663 BCRP11274 1271 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 CTGFP29279 349 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 UBXN2AP68543 259 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PNMA3Q9UL41 463 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SLURP2P0DP57 97 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM196BA6NMK8 535 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 IGSF3O75054 1194 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
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