RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 RASIP1Q5U651 963 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 TRIM37O94972 964 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 FOSL1P15407 271 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 LRRC14Q15048 493 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC27Q2M243 656 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 SV2BQ7L1I2 683 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 PARP2Q9UGN5 583 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.53□□□□□ -1.2
UBE2B-203ENST00000503080 SPINK2P20155 84 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ERVK-24P63145 666 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 DTX1Q86Y01 620 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 RNF214Q8ND24 703 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CSADQ9Y600 493 aa7.52□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CYP26A1O43174 497 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 NEFMP07197 916 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CYP27A1Q02318 531 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CDK5R2Q13319 367 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.51□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ADAMTS4O75173 837 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 DAB2P98082 770 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PSMD2Q13200 908 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PPM1JQ5JR12 505 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 C12orf40Q86WS4 652 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ISL2Q96A47 359 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 FAM161BQ96MY7 647 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.5□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 MSMPQ1L6U9 139 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.49□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ERCC3P19447 782 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 TMC4Q7Z404 712 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 PICK1Q9NRD5 415 aa7.48□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 WNT11O96014 354 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 FAM87AP0C7U9 286 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 RING1Q06587 406 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 INPP5AQ14642 412 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-203ENST00000503080 NTF4P34130 210 aa7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 MAP3K11Q16584 847 aa7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 FANCGO15287 622 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 LEFTY1O75610 366 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 CTSHP09668 335 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 LMNB1P20700 586 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 SORBS3O60504 671 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 LIG3P49916 1009 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 HDXQ7Z353 690 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 PRNPP04156 253 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 CDK8P49336 464 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 SEPT6Q14141 434 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 MRS2Q9HD23 443 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 USP31Q70CQ4 1352 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 RLBP1P12271 317 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-203ENST00000503080 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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