RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 AOC2O75106 756 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 PDE6AP16499 860 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 ADD2P35612 726 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 UBE3CQ15386 1083 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 ZIC5Q96T25 663 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 BCL11AQ9H165 835 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 FZD1Q9UP38 647 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-206ENST00000462743 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MX1P20591 662 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 NUCB1Q02818 461 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 SPRYD7Q5W111 196 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CSRNP1Q96S65 589 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MYH7P12883 1935 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TM4SF4P48230 202 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PDE1AP54750 535 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 INHBEP58166 350 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TICAM2Q86XR7 235 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 FOCADQ5VW36 1801 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CA12O43570 354 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 GRM1Q13255 1194 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PICALMQ13492 652 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 WNK4Q96J92 1243 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 WRNIP1Q96S55 665 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CSADQ9Y600 493 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MYH1P12882 1939 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 VGLL4Q14135 290 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ERO1BQ86YB8 467 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 LNPKQ9C0E8 428 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 FLT1P17948 1338 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 OTOFQ9HC10 1997 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 LAMB1P07942 1786 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 FOXN1O15353 648 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 INPP5BP32019 993 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 GJA5P36382 358 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 AIDAQ96BJ3 306 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 ELP3Q9H9T3 547 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-206ENST00000462743 PPATQ06203 517 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 SREBF2Q12772 1141 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 OPTNQ96CV9 577 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.58□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 USP5P45974 858 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 PPIL2Q13356 520 aa14.57□□□□□ -0.08
HPS1-206ENST00000462743 TTC6Q86TZ1 520 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms