RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366960.7

RPS6KC1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-202ENST00000366960 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 CHMP2AO43633 222 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 PTH1RQ03431 593 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 LRMPQ12912 555 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.04■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 TEX11Q8IYF3 940 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 GCKRQ14397 625 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 C8orf37Q96NL8 207 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP2A1O14983 1001 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC38Q5R3I4 469 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLF1Q9BQI6 1058 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 CUTAO60888 179 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRAF1Q13077 416 aa16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 PLCD1P51178 756 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 NLRP12P59046 1061 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 DYMQ7RTS9 669 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 CALCOCO2Q13137 446 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 C8orf74Q6P047 294 aa16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RPS6KC1-202ENST00000366960 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 PLCG2P16885 1265 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TUBB4BP68371 445 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF354CQ86Y25 554 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 MLKLQ8NB16 471 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 SH3TC1Q8TE82 1336 aa16.02■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 NR1I2O75469 434 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 PAK1Q13153 545 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 PNOCQ13519 176 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 CYP26C1Q6V0L0 522 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ORAI2Q96SN7 254 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 USP44Q9H0E7 712 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ASXL2Q76L83 1435 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 E7EWF7 191 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCNQ3O43525 872 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TUBBP07437 444 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 NYXQ9GZU5 481 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 A0A0D9SFI3 127 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 BACH1O14867 736 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 POSTNQ15063 836 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 PZPP20742 1482 aa16.01■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 AOX1Q06278 1338 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 NDUFAB1O14561 156 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 FERP16591 822 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 DDX12PQ92771 950 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 C19orf44Q9H6X5 657 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARHGAP6O43182 974 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 VIMP08670 466 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAEAQ7L5Y9 396 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 USP28Q96RU2 1077 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 BCL2L12Q9HB09 334 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPOPO43791 374 aa16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC14Q96N46 770 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC6Q86TZ1 520 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 GNPATO15228 680 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 KRT5P13647 590 aa15.99■□□□□ 0.15
RPS6KC1-202ENST00000366960 BIRC3Q13489 604 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms