RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ALG1L2C9J202 215 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD7Q7Z3H4 446 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 IL17REQ8NFR9 667 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KIFC2Q96AC6 838 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF21O75509 655 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MICAL2O94851 1124 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SCUBE3Q8IX30 993 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 HINFPQ9BQA5 517 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NHSQ6T4R5 1651 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 COL6A3P12111 3177 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DUOX1Q9NRD9 1551 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SNPHO15079 494 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP10O43572 662 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DACT2Q5SW24 774 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FAM43AQ8N2R8 423 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 OTUD5Q96G74 571 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SH3BP5O60239 455 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf91Q3C1V1 193 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 STRA8Q7Z7C7 330 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EDEM1Q92611 657 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KLRG1Q96E93 195 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GJD2Q9UKL4 321 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EFR3BQ9Y2G0 817 aa3.24□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CDC27P30260 824 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SMTNP53814 917 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DOK7Q18PE1 504 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MPNDQ8N594 471 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PLD4Q96BZ4 506 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DZANK1Q9NVP4 752 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KLF15Q9UIH9 416 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 BCL9LQ86UU0 1499 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRGP23470 1445 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC18Q5T9S5 1454 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ROBO2Q9HCK4 1378 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TBX3O15119 743 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 APBA3O96018 575 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L7P0C7H9 530 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CD53P19397 219 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GBX1Q14549 363 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TNNI3KQ59H18 835 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GPATCH11Q8N954 259 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EHMT1Q9H9B1 1298 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NEUROD4Q9HD90 331 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C4AP0C0L4 1744 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 C4BP0C0L5 1744 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PLCH2O75038 1416 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRKQ15262 1439 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 F2P00734 622 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GRM2Q14416 872 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SV2BQ7L1I2 683 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 DGKHQ86XP1 1220 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 FOXJ1Q92949 421 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SPON2Q9BUD6 331 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 EEA1Q15075 1411 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 ITSN1Q15811 1721 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 E2F8A0AVK6 867 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 LMNB2Q03252 620 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RTN1Q16799 776 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
CCSAP-202ENST00000366686 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms