RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 NPR1P16066 1061 aa25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE6BP35913 854 aa25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA32Q96LK8 384 aa25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB43O43298 467 aa25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CDKL5O76039 1030 aa25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SRGNP10124 158 aa25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 IL1R1P14778 569 aa25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SNRNP25-201ENST00000293861 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.14■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 SENP2Q9HC62 589 aa25.14■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CD209Q9NNX6 404 aa25.14■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.14■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 FGRP09769 529 aa25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TMTC2Q8N394 836 aa25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RCAN1P53805 252 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 GSTO1P78417 241 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ALDH1B1P30837 517 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RBSNQ9H1K0 784 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 POLLQ9UGP5 575 aa25.12■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC69A6NI79 296 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 C8orf76Q96K31 380 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 JAG2Q9Y219 1238 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.11■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 NTRK3Q16288 839 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ESR2Q92731 530 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ERICH2A1L162 156 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC27P30260 824 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 WTAPQ15007 396 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CTR9Q6PD62 1173 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TOMM22Q9NS69 142 aa25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA8AA7E2F4 631 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 MICU3Q86XE3 530 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 MASTLQ96GX5 879 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 STK36Q9NRP7 1315 aa25.09■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 C6orf229H3BNL8 230 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 PPFIA3O75145 1194 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 LDHCP07864 332 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 FOSBP53539 338 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 SBK1Q52WX2 424 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPY26PQ9H489 355 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.08■■□□□ 1.61
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC15A2Q16348 729 aa25.08■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 GUCY1B3Q02153 619 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 SEC23AQ15436 765 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 CERS3Q8IU89 383 aa25.07■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 MSL1Q68DK7 614 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 STK32BQ9NY57 414 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH6P13533 1939 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L12C9JPN9 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 USP17L21D6R901 530 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 BAG3O95817 575 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 RXRAP19793 462 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP4CP60510 307 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 BRAPQ7Z569 592 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 PGBD1Q96JS3 809 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.06■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ORC4O43929 436 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 IFNAR1P17181 557 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.05■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 NT5C2P49902 561 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R5BQ15173 497 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 USP28Q96RU2 1077 aa25.04■■□□□ 1.6
SNRNP25-201ENST00000293861 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.04■■□□□ 1.6
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