RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 OTOFQ9HC10 1997 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 MOB2Q70IA6 237 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 SKAP1Q86WV1 359 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 LCORLQ8N3X6 602 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 FKBP1BP68106 108 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 APPBP2Q92624 585 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 FLT1P17948 1338 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 SIPA1L1O43166 1804 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 MBD4O95243 580 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKG1Q13976 671 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 TTC22Q5TAA0 569 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 OSBP2Q969R2 916 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ARMT1Q9H993 441 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 HUNKP57058 714 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 RILPL2Q969X0 211 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 CSRNP1Q96S65 589 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 RASSF10A6NK89 507 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 AIDAQ96BJ3 306 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K11Q16584 847 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 TICAM2Q86XR7 235 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 USP5P45974 858 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 HOOK2Q96ED9 719 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 M0R2C6 588 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKAB2O43741 272 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 PALD1Q9ULE6 856 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 GPAA1O43292 621 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 SDSP20132 328 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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SLC25A39-201ENST00000225308 DCAF15Q66K64 600 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 KLRG1Q96E93 195 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0D9SFI3 127 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K10Q02779 954 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM227BQ96M60 508 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.781e-6■□□□□ 11
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SLC25A39-201ENST00000225308 RGMBQ6NW40 437 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.14■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 WRNIP1Q96S55 665 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM196BA6NMK8 535 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.12■■□□□ 1.77
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SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 UNCXA6NJT0 531 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D12O60347 775 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 VEGFBP49765 207 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 CAPNS2Q96L46 248 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 THSD7BQ9C0I4 1608 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC18Q9H819 358 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAT2P19087 354 aa26.1■■□□□ 1.77
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