RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm14548	E9Q1Z6	680 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klhl33	G3UW92	533 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map2k1	P31938	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rplp1	P47955	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddb1	Q3U1J4	1140 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Map3k9	Q3U1V8	1077 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc93	Q7TQK5	629 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpatch3	Q8BIY1	525 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab11fip4	Q8BQP8	635 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc113	Q8C5T8	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Afg3l2	Q8JZQ2	802 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif18a	Q91WD7	886 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grk2	Q99MK8	689 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cela3b	Q9CQ52	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sapcd2	Q9D818	391 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9DAR0	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ngdn	Q9DB96	315 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Xpo4	Q9ESJ0	1151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aoah	O35298	574 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nefl	P08551	543 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pla2g2c	P48076	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rasa2	P58069	847 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Traf5	P70191	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnfrsf26	P83626	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Intu	Q059U7	942 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf180	Q3U827	592 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grik1	Q60934	836 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Naa15	Q80UM3	865 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ip6k2	Q80V72	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cnot4	Q8BT14	575 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mcam	Q8R2Y2	648 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sec16b	Q91XT4	1051 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim66	Q924W6	1242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cenpp	Q9CZ92	286 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpap3	Q9D706	660 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dbn1	Q9QXS6	706 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Urb2	E9Q7L1	1524 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm18336	A0A140LIU8	765 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rfx8	D3YU81	596 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Yjefn3	F6W8I0	251 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc32	G3XA59	663 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp2b1	G5E829	1220 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pfdn2	O70591	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il4r	P16382	810 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dsc1	P55849	886 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mkl2	P59759	1080 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Larp7	Q05CL8	570 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam193b	Q3U2K0	892 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc10a4	Q3UEZ8	437 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	PRAG1	Q571I4	1179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bbs9	Q811G0	885 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cc2d1b	Q8BRN9	848 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Utp15	Q8C7V3	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Yod1	Q8CB27	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dmtf1	Q8CE22	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adgrg2	Q8CJ12	1009 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ablim1	Q8K4G5	861 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Blmh	Q8R016	455 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epn3	Q91W69	636 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmx2	Q9D710	295 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nr2e3	Q9QXZ7	395 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dlc1	Q9R0Z9	1092 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aebp2	Q9Z248	504 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nt5c1a	A3KFX0	365 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttll8	A4Q9F1	832 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10110	D3Z5M2	615 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm2956	E9PVJ0	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr78	E9PYY5	807 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8108	K7N734	216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3488	M0QW81	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Xirp1	O70373	1129 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptpra	P18052	829 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ckmt1	P30275	418 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp6v1a	P50516	617 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cidec	P56198	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fhdc1	Q3ULZ2	1149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde3b	Q61409	1100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttf1	Q62187	859 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dgkb	Q6NS52	802 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk4	Q6P5G0	583 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd13d	Q6PD24	605 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pabpc4	Q6PHQ9	660 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aldh1l1	Q8R0Y6	902 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adgrf1	Q8VEC3	908 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mark1	Q8VHJ5	795 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hps3	Q91VB4	1002 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rrp9	Q91WM3	475 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tlr3	Q99MB1	905 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9CR55	154 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snx2	Q9CWK8	519 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serhl	Q9EPB5	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jph1	Q9ET80	660 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gipc1	Q9Z0G0	333 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgef5	E9Q7D5	1581 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm597	E9Q8J5	896 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ap1b1	O35643	943 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mpp1	P70290	466 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cplx2	P84086	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Svip	Q3UZP4	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf20	Q5DTM8	973 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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