RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	NCAPD3	P42695	1498 aa		13.21	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.21	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.18	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.17	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.16	□□□□□ -0.3
MFSD8-256	ENST00000641949	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MFSD8-256	ENST00000641949	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MFSD8-256	ENST00000641949	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MFSD8-256	ENST00000641949	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MFSD8-256	ENST00000641949	WIZ	O95785	1651 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MFSD8-256	ENST00000641949	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
MFSD8-256	ENST00000641949	CREBZF	Q9NS37	354 aa		12.95	□□□□□ -0.34
MFSD8-256	ENST00000641949	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
MFSD8-256	ENST00000641949	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.94	□□□□□ -0.34
MFSD8-256	ENST00000641949	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
MFSD8-256	ENST00000641949	PROM2	Q8N271	834 aa		12.91	□□□□□ -0.34
MFSD8-256	ENST00000641949	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MFSD8-256	ENST00000641949	NES	P48681	1621 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MFSD8-256	ENST00000641949	ERCC6	Q03468	1493 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.83	□□□□□ -0.36
MFSD8-256	ENST00000641949	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		12.82	□□□□□ -0.36
MFSD8-256	ENST00000641949	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
MFSD8-256	ENST00000641949	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
MFSD8-256	ENST00000641949	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
MFSD8-256	ENST00000641949	CFTR	P13569	1480 aa		12.76	□□□□□ -0.37
MFSD8-256	ENST00000641949	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
MFSD8-256	ENST00000641949	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.71	□□□□□ -0.37
MFSD8-256	ENST00000641949	CLCN6	P51797	869 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.7	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		12.69	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	FKBP8	Q14318	412 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.67	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.66	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		12.66	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		12.65	□□□□□ -0.38
MFSD8-256	ENST00000641949	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.64	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	CUX2	O14529	1486 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.61	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	12.59	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
MFSD8-256	ENST00000641949	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	PRDM2	Q13029	1718 aa		12.56	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.55	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	WDR62	O43379	1518 aa		12.53	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	MIER1	Q8N108	512 aa		12.52	□□□□□ -0.4
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.51	□□□□□ -0.41
MFSD8-256	ENST00000641949	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
MFSD8-256	ENST00000641949	TOPBP1	Q92547	1522 aa		12.47	□□□□□ -0.41
MFSD8-256	ENST00000641949	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.44	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.42	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	RASEF	Q8IZ41	740 aa		12.41	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	12.4	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		12.4	□□□□□ -0.42
MFSD8-256	ENST00000641949	CUX1	P39880	1505 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	IFT140	Q96RY7	1462 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	SOGA1	O94964	1423 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	PLEKHG5	O94827	1062 aa		12.39	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		12.38	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	12.38	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		12.36	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		12.34	□□□□□ -0.43
MFSD8-256	ENST00000641949	NUBP1	P53384	320 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.33	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.32	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	TOP2B	Q02880	1626 aa		12.31	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	SYNJ1	O43426	1573 aa		12.3	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	TRIM41	Q8WV44	630 aa		12.27	□□□□□ -0.44
MFSD8-256	ENST00000641949	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		12.27	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	MAP3K13	O43283	966 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.26	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		12.25	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		12.24	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		12.22	□□□□□ -0.45
MFSD8-256	ENST00000641949	GRIN2B	Q13224	1484 aa		12.2	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.19	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	KIF27	Q86VH2	1401 aa		12.15	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
MFSD8-256	ENST00000641949	POTEJ	P0CG39	1038 aa		12.15	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.14	□□□□□ -0.47

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