RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640718.1

AC011416.4-204, humanhuman

TSL 5

Gene AC011416.4, Length 1,428 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC011416.4-204ENST00000640718 GRIN2AQ12879 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 IGF1RP08069 1367 aa22.88■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.87■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 CUL7Q14999 1698 aa22.85■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.85■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 CEP170Q5SW79 1584 aa22.84■■□□□ 1.25
AC011416.4-204ENST00000640718 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.81■■□□□ 1.24
AC011416.4-204ENST00000640718 NUP160Q12769 1436 aa22.76■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.73■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.73■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.73■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.72■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 ARHGEF11O15085 1522 aa22.7■■□□□ 1.23
AC011416.4-204ENST00000640718 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.65■■□□□ 1.22
AC011416.4-204ENST00000640718 SHROOM2Q13796 1616 aa22.63■■□□□ 1.21
AC011416.4-204ENST00000640718 PRXQ9BXM0 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
AC011416.4-204ENST00000640718 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
AC011416.4-204ENST00000640718 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.62■■□□□ 1.21
AC011416.4-204ENST00000640718 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
AC011416.4-204ENST00000640718 ARAP1Q96P48 1450 aa22.55■■□□□ 1.2
AC011416.4-204ENST00000640718 EEA1Q15075 1411 aa22.55■■□□□ 1.2
AC011416.4-204ENST00000640718 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.54■■□□□ 1.2
AC011416.4-204ENST00000640718 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.54■■□□□ 1.2
AC011416.4-204ENST00000640718 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.52■■□□□ 1.2
AC011416.4-204ENST00000640718 IQGAP2Q13576 1575 aa22.5■■□□□ 1.19
AC011416.4-204ENST00000640718 KIF21BO75037 1637 aa22.47■■□□□ 1.19
AC011416.4-204ENST00000640718 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
AC011416.4-204ENST00000640718 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
AC011416.4-204ENST00000640718 JPH4Q96JJ6 628 aa22.45■■□□□ 1.18
AC011416.4-204ENST00000640718 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.4■■□□□ 1.18
AC011416.4-204ENST00000640718 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.4■■□□□ 1.18
AC011416.4-204ENST00000640718 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AC011416.4-204ENST00000640718 DISP1Q96F81 1524 aa22.36■■□□□ 1.17
AC011416.4-204ENST00000640718 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.35■■□□□ 1.17
AC011416.4-204ENST00000640718 KIAA0556O60303 1618 aa22.32■■□□□ 1.16
AC011416.4-204ENST00000640718 GOLGA3Q08378 1498 aa22.28■■□□□ 1.16
AC011416.4-204ENST00000640718 SAMD9Q5K651 1589 aa22.23■■□□□ 1.15
AC011416.4-204ENST00000640718 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
AC011416.4-204ENST00000640718 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.22■■□□□ 1.15
AC011416.4-204ENST00000640718 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
AC011416.4-204ENST00000640718 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
AC011416.4-204ENST00000640718 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.17■■□□□ 1.14
AC011416.4-204ENST00000640718 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
AC011416.4-204ENST00000640718 PTPRGP23470 1445 aa22.14■■□□□ 1.14
AC011416.4-204ENST00000640718 P3H3Q8IVL6 736 aa22.14■■□□□ 1.13
AC011416.4-204ENST00000640718 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.09■■□□□ 1.13
AC011416.4-204ENST00000640718 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.09■■□□□ 1.13
AC011416.4-204ENST00000640718 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCA8O94911 1581 aa22.06■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.05■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCC2Q92887 1545 aa22.05■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 UACAQ9BZF9 1416 aa22.03■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.03■■□□□ 1.12
AC011416.4-204ENST00000640718 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22■■□□□ 1.11
AC011416.4-204ENST00000640718 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
AC011416.4-204ENST00000640718 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.97■■□□□ 1.11
AC011416.4-204ENST00000640718 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.95■■□□□ 1.1
AC011416.4-204ENST00000640718 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.94■■□□□ 1.1
AC011416.4-204ENST00000640718 MAPKBP1O60336 1514 aa21.93■■□□□ 1.1
AC011416.4-204ENST00000640718 CLIP1P30622 1438 aa21.9■■□□□ 1.1
AC011416.4-204ENST00000640718 ARID3CA6NKF2 412 aa21.89■■□□□ 1.1
AC011416.4-204ENST00000640718 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.89■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 CEP162Q5TB80 1403 aa21.87■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 DIP2BQ9P265 1576 aa21.87■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 ASXL2Q76L83 1435 aa21.86■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 ATP10BO94823 1461 aa21.83■■□□□ 1.09
AC011416.4-204ENST00000640718 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
AC011416.4-204ENST00000640718 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.8■■□□□ 1.08
AC011416.4-204ENST00000640718 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
AC011416.4-204ENST00000640718 HECW1Q76N89 1606 aa21.77■■□□□ 1.08
AC011416.4-204ENST00000640718 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.76■■□□□ 1.07
AC011416.4-204ENST00000640718 TSPOAP1O95153 1857 aa21.75■■□□□ 1.07
AC011416.4-204ENST00000640718 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
AC011416.4-204ENST00000640718 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
AC011416.4-204ENST00000640718 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.71■■□□□ 1.07
AC011416.4-204ENST00000640718 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.7■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.69■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 POTEDQ86YR6 584 aa21.68■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 GLI2P10070 1586 aa21.68■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.67■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 ZBTB22O15209 634 aa21.66■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.65■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
AC011416.4-204ENST00000640718 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.63■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 KCNH8Q96L42 1107 aa21.63■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 KIF14Q15058 1648 aa21.6■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 SLC4A2P04920 1241 aa21.6■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.6■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.59■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.58■■□□□ 1.05
AC011416.4-204ENST00000640718 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.56■■□□□ 1.04
AC011416.4-204ENST00000640718 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.56■■□□□ 1.04
AC011416.4-204ENST00000640718 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms